أجاز مجلس أمناء جامعة الأمير محمد بن فهد الخطة الخمسية الثانية للجامعة للفترة من 2012م إلى 2016 م، وذلك في اجتماعه السادس يوم الاثنين الماضي 19 محرم 1434 الموافق 3 ديسمبر 2012 والذي عقد برئاسة صاحب السمو الملكي الأمير محمد بن فهد بن عبد العزيز أمير المنطقة الشرقية، رئيس مجلس أمناء الجامعة والذي عقد في مقر إمارة المنطقة الشرقية.
وناقش المجلس تفاصيل الخطة الخمسية والتي اشتملت على العديد من الأهداف المتصلة بمختلف المجالات المتعلقة بالنواحي الأكاديمية والإدارية والبحثية والتقنية ومتطلبات تطور الجامعة، كجامعة تنشد التميّز وتطبيق المواصفات العالمية في كافة أنشطتها وكذلك وضع مبادرات إستراتيجية لتحقيق كافة الأهداف التي تتضمنها الخطة الإستراتيجية.ففي مجال الطلاب، تهدف الخطة إلى زيادة عدد الطلاب المتميّزين الذين يختارون الالتحاق بالجامعة كرغبة أولى وتطوير البرامج الإرشادية لاستبقاء الطلاب بالجامعة وتقليل الوقت اللازم للتخرج، وأن تستمر الجامعة في تزويد طلابها بتجارب تعلميه متميّزة.وفي مجال العمل الإداري والتقنية، تهدف الخطة إلى أن يستمر الحرم الجامعي في امتلاك التقنيات المتقدمة لدعم البحوث والأنشطة الأكاديمية والإبداع وتطوير العمليات الإدارية بالجامعة وتطوير بيئة داعمة ومحفزة للأساتذة والموظفين والتركيز على الخدمات المقدمة لهم وتحسينها باستمرار.وتهدف الخطة كذلك إلى الاستمرار في تحسين سمعة الجامعة وإبرازها محلياً وعالمياً، وإيجاد وتطوير ثقافة بحثية وبنية تحتية مساندة، إضافة إلى استقطاب الدعم للمشاريع البحثية من مصادر محلية وعالمية، على أن تقوم الجامعة بالتوسع في مصادر عائداتها وتنويعها لدعم النمو المستمر في أطار رسالتها وأهدافها الإستراتيجية، وكذلك تهدف الخطة إلى التطوير والتوسع في المباني والمرافق المساندة لاستيعاب النمو المستقبلي للجامعة، والاستمرار في تطبيق معايير الجودة في كل وظائف الجامعة والعمل على الحصول على الاعتماد الأكاديمي من الجهات المحلية والعالمية.